Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms