Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl3E0CZ16 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms