Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1500009C09RikD3YYW9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1500009C09RikD3YYW9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms