Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6685D3YYP3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6685D3YYP3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms