Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC048679D3YXE9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms