Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms