Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia1B2RXQ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia1B2RXQ2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms