Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cspp1B2RX88 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms