Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox1B1APN4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms