Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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