Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms