Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam71e1A1L3C1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71e1A1L3C1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms