Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930469K13RikA0A286YDB2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms