Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms