Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms