Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Irx2P81066 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms