Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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