Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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