Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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