Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc18Q640L5 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc18Q640L5 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc18Q640L5 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ccdc18Q640L5 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccdc18Q640L5 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccdc18Q640L5 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccdc18Q640L5 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccdc18Q640L5 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.9 ms