Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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