Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 G730013B05Rik-201ENSMUST00000180509 2176 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm38404-201ENSMUST00000202005 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Nefm-201ENSMUST00000022638 3334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Camk2a-201ENSMUST00000025519 3244 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Hist2h2be-201ENSMUST00000090781 2620 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms