Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Fabp12-201ENSMUST00000029043 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm12002-202ENSMUST00000153794 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Trim21-201ENSMUST00000033264 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Echdc3-201ENSMUST00000042658 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37157-201ENSMUST00000192120 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37112-201ENSMUST00000194389 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Trpd52l3-201ENSMUST00000025727 2231 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm12949-201ENSMUST00000143382 362 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Gm6063-201ENSMUST00000206958 485 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26792-201ENSMUST00000180538 2799 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mirg-212ENSMUST00000183144 3797 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Casc1-201ENSMUST00000060797 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp946-202ENSMUST00000120222 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm12983-201ENSMUST00000120974 310 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms