Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms