Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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