Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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