Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ldb2-207ENSMUST00000199534 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gem-201ENSMUST00000029868 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rab23-202ENSMUST00000115174 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Hp1bp3-203ENSMUST00000105825 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC156273.1-201ENSMUST00000214570 2762 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tmem175-203ENSMUST00000120327 1811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Tyrp1-202ENSMUST00000102831 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Trappc12-202ENSMUST00000168129 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cga-202ENSMUST00000108130 609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms