Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms