Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc71Q8VEG0 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms