Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Actn1Q7TPR4 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms