Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Cntn3Q07409 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Cntn3Q07409 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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