Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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