Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt6bQ9Z331 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt6bQ9Z331 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms