Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Top3bQ9Z321 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms