Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms