Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd2Q9Z2E1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms