Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HnrnpcQ9Z204 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HnrnpcQ9Z204 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms