Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms