Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccl8Q9Z121 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccl8Q9Z121 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccl8Q9Z121 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccl8Q9Z121 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccl8Q9Z121 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccl8Q9Z121 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ccl8Q9Z121 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccl8Q9Z121 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl8Q9Z121 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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