Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tusc2Q9WVF8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms