Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec2Q9WV35 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms