Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrf1Q9WU00 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms