Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psma1Q9R1P4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms