Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra1Q9R118 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms