Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed2Q9R0Q3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms