Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms