Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms