Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms