Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jag1Q9QXX0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Jag1Q9QXX0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jag1Q9QXX0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms