Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms